パートナーのYです。
追跡番号を付けて送っていても、途中で行方が分からなくなり、「商品が未着」とのメールが来たり、Case(Request)にされたりして、止むを得ず全額返金することがあります。
ところが、その後、追跡結果を見ると配達が確認でき、Buyerに連絡をして再度の支払いを求めますが、Buyerによっては無視されてしまいます。
このような場合に、Sellerとして何ができるかについて、ebayに問合せしてみたところ、その返答は以下のようなものでした。
せっかくご連絡頂いたところ、大変申し訳ないのですが、
セラー様より自主返金をしていただいた際、eBayではバイヤー様に再度のお支払いを強制することが出来かねてしまいますので、バイヤー様のお返事をお待ちいただくしか方法がございません。
なお、この時に具体例として質問で引用した取引については、その落札手数料を返還してくれました。そして、ケースとの関係を、更に確認した結果は以下の通りです。
Caseになる前後に関わらず、自主的に返金をしていただいた際は、バイヤー様に再度ご入金を強制することは出来かねてしまいます。
また、ケース判断がバイヤー様有利にて終了した後、配送業者による調査などによって、ケース判断前にバイヤー様の元へ商品が届いていたと証明できる場合はセラー様に商品代金を返金できる可能性もございます（お取引の状況によっては、必ずしも返金できるとは限りません）が、
証明が出来なかった場合、アカウントの評価に影響が出てしまう可能性もあるため、
ケースになる前にバイヤー様と交渉頂き、商品受け取り拒否をご依頼の上で返金していただいた方がよろしいかと存じます。
また、返金後にバイヤー様が商品をお受け取りになられた際は、メッセージ上で再入金のご交渉を頂きますよう、宜しくお願い致します。
ややこしいので、まとめると、以下の通りです。
・ケースの有無に係わらず、途中で自主的に返金した場合は、メールでやり取りをして、支払いをお願いするしかない。
・ケースの判断がEbayに持ち込まれた場合、Ebayが判断を下す時点より前までに、配達完了していたことを証明できない限り、Buyer有利の判断後の返金の可能性はない。
なお、自主返金の際に、「今後は、届いても受取拒否して欲しい」とお願いするようにと推奨されていますが、あまり現実的・効果的ではないように思います。（それを受入れるBuyerなら、「もし、後から到着した時には伝えて欲しい」と言う依頼も聞いてくれ、再支払いもしてくれるような気がするためです。）
いずれにせよ残念ですが、Sellerはあまり弱い立場です。